①先ずは電源を入れるとBIOSが起動します。これはどんな装置があるのか確認します（Power On Self Test）。
②MBRを読み込みます。どんなディスク構成になっているかなぁ・・・・とパソコンが調べます（⇒MBR内のブートストラップローダが実行される）。さらに、ブートセクタをメモリに読み込む。
③ブートセクタはOSのシステムがどこにあるかを知らせます（⇒ブート処理がされて、ブートローダ　が読み込まれる）。
④ブートローダー（OSのシステムファイル＝カーネル）が起動します。マルチブート（OSを切り替えて起動する）を採用していればここで、OSを選べるわけです。

これで、Windowsが起動するわけです。
ウイルスに感染して、起動できなくなった？
良く聞く話です。ウイルスの中にはマスターブレードを書き換えるものがあります。そのためウイルスソフトは毎回ここも調べるわけですね。
よって、順番としては以下のとおり。
BIOS->MBR（マスターブレード）->ブートセクタ->OS（Windowsのシステム）

　　＃参照情報；
　　　　・http://www.sp-mail.com/school/koukai/tech/tech005.htm
　　　　・http://homepage2.nifty.com/winfaq/howtoboot.html
　　　　・http://nobumasa-web.hp.infoseek.co.jp/boot/boot.html